Tāpat kā narkotikas, organismā arī ksenobiotiķi tiek pakļauti biotransformācijas procesiem, kuru mērķis ir padarīt tos ūdenī šķīstošākus un atvieglot to izvadīšanu.
Pēc dažādiem biotransformācijas procesiem, ko izmanto daudzi fermenti (1. fāze un 2. fāze), un to aktivācijai, ksenobiotikiem var būt dažādi likteņi:
- izdalās kā tāds (piemēram, etilēteris);
- neaktīvie izdalījumi;
- joprojām aktīvi izdalījumi (piemēram, antrakinona glikozīdi vai antrakinoni);
- pārveidoti par toksiskiem vai ļoti toksiskiem savienojumiem;
Ir veikti daži biotransformācijas piemēri.
Aromātiskie amīni pēc -OH grupu ievadīšanas slāpeklī izraisa kancerogēnus metabolītus aknās.
PAH ar TCDD (dioksīniem), PCB un benzofurāniem ir visi savienojumi, kas pazīstami kā "farmakometaboliskie induktori", tādējādi paātrinot farmakometabolisko iedarbību uz citohroma P450 līmeni, palielinot šo vielu metabolismu, kam ir nopietna ietekme uz gēnu transkripcija.
Mēs runājam par bioaktivāciju, ja sākotnējam toksiskajam aģentam nav pietiekamas afinitātes ar mērķa vietu, tāpēc tā tiek pārveidota par ļoti līdzīgu metabolītu.