Malārijas profilakse ietver dažādu uzvedību, tostarp, ja iespējams, saglabāšanu aizsargājamās teritorijās, līdz minimumam samazinot odu virsmu, kas pakļauta odiem, un nakts laikā izmantojot kukaiņu repelentus un moskītu tīklus.
Turklāt attiecībā uz malāriju Pasaules Veselības organizācija iesaka profilaksei veikt ar atovakvona-proguanilu, doksiciklīnu un meflokīnu . Šīs zāles ir jāparaksta ārstējošajam ārstam, pamatojoties uz ģeogrāfisko apgabalu, kurā tas notiek, parazītu sugām un risku saslimt ar slimību.
Pateicoties plazmodijas rezistencei pret pretmalārijas zālēm, hlorokvīns ir noderīgs tikai ceļotājiem, kas dodas uz Karību un Centrālameriku uz ziemeļiem no Panamas kanāla.
