Pirmie pierādījumi par cilvēka imūndeficīta vīrusu ( HIV ) ir iegūti no Āfrikas pacientiem 1950. gados. Tiek uzskatīts, ka pirmā infekcija notika Āfrikā pēc infekcijas no citām inficētu primātu sugām. Faktiski HIV-1 ir pērtiķu imūndeficīta vīrusa ( SIV ) mutācijas versija, kas dzīvojusi kopā ar šiem dzīvniekiem jau simtiem gadu. Vīrusu aģents (identificēts kā HIV-1 grupa M) sākotnēji tika nosūtīts cilvēkiem uz šimpanzēm .
Faktiski šis posms būtu noticis vairāk nekā vienu reizi Centrālajā Āfrikā, divdesmitā gadsimta sākumā, bet tikai viens no šiem gadījumiem izraisīja AIDS epidēmijas uzliesmojumu cilvēku vidū. Pētījums, ko veica starptautiska pētniecības grupa, kas publicēta "Zinātne", atjaunoja AIDS ģenētisko un epidemioloģisko vēsturi ("HIV-1 agrīna izplatība un epidēmija cilvēku populācijās", Science 2014, 3. oktobris; .3466 6205, 56-61. Lpp. Salīdzinot simtiem HIV paraugu ģenētiskās sekas no dažādām Āfrikas daļām, pētniecības grupa ir izveidojusi sava veida ģenealoģisko koku. Pielietojot zināšanas par vīrusu mutāciju ātrumu, zinātnieki varēja sasaistīt dažādas ģimenes koka nozares ar pieejamajiem vēsturiskajiem datiem . Tādējādi bija iespējams izsekot AIDS epidēmijas izcelsmei : vīruss pirmo reizi 1920. gadā izplatījās uz Kinshasu, kas ir pašreizējā Kongo Republikas galvaspilsēta.
20. gadsimta sākumā Kinshasa bija plaukstoša koloniālā pilsēta, kas bija plaukstošas tirdzniecības centrs; pēc dzelzceļa satiksmes paplašināšanās tā kļuva par vienu no vislabāk piesaistītajām pilsētām Centrālajā Āfrikā, un tiek lēsts, ka simtiem tūkstošu pagājušā gadsimta 40 gadu beigās tas notika. Vīrusa ģenētiskā pielāgošanās spēja, iedzīvotāju skaita pieaugums, transporta attīstība, prostitūcija, citu infekcijas slimību klātbūtne un ieradums lietot sterilizētas šļirces slimnīcās ir visi faktori, kas veicināja vīrusa nonākšanu pilsētā un citās Āfrikas valstīs, tāpēc pārējā pasaulē .
