Japāņu encefalīts ir izplatīts gandrīz visās Āzijas valstīs un dažos Okeānijas reģionos. Inficēšanās risks parasti ir ierobežots vairumam ceļotāju, tomēr jāņem vērā galamērķis, uzturēšanās laiks un darbības, kas veiktas uzturēšanās laikā.
Bīstamās teritorijas ir galvenokārt lauku un lauksaimniecības teritorijas, jo īpaši tās, kas paredzētas rīsu audzēšanai, kurā slimība ir endēmiska. Tomēr gadījumi, kas atrodas tuvu pilsētām vai pilsētu centros, nav reti, ja pastāv apstākļi, kas ir labvēlīgi odu attīstībai.
Dienvidaustrumāzijā visu gadu ir sastopams risks saslimt ar inficēto moskītu iekaisumu, akcentējot musonu lietus līdz sausās sezonas sākumam; mērenajos reģionos Ķīnā, Japānā un Korejas pussalā pārsūtīšana ir lielāka no maija līdz septembrim (pārvadātāju lielākas aktivitātes periods). Ceļojot uz endēmiskām zonām, var ieteikt vakcināciju.
